Przewlekła choroba nerek powoduje pogorszenie funkcji układu immunologicznego, czego efektem jest osłabienie odporności organizmu. W konsekwencji sprzyja to infekcjom oraz pogarsza ich przebieg, mając wpływ na ogólny stan zdrowia. Wraz z nasilaniem się stopnia niewydolności nerek, ulega pogorszeniu zdolność organizmu do wytwarzania przeciwciał odpornościowych na skutek stosowanych szczepień ochronnych - maleje efektywność szczepień. Dlatego też zaleca się, aby szczepienia u pacjentów z niewydolnością nerek były przeprowadzane w jak najwcześniejszych stadiach choroby, aby uzyskać ich jak najlepszy efekt. Jest to ważne szczególnie w przypadku osób w podeszłym wieku, z licznymi chorobami towarzyszącymi (astma oskrzelowa, przewlekła obturacyjna choroba płuc, cukrzyca, niewydolność serca) oraz u tych, u których rozważa się kwalifikację do transplantacji nerki i związaną z nią konieczność stosowania przewlekłego leczenia immunosupresyjnego. Szczepienia zalecane to: szczepienie przeciwko wirusowemu zapaleniu wątroby typu B, sezonowe szczepienie przeciwko grypie i u wybranej grupy osób- przeciwko pneumokokom.